Funeriu mai este acuzat că "tolerează o situaţie la limita legii legată de rectorul aceleiaşi universităţi, controversata Lizica Mihuţ, care a reuşit să ocupe gradele universitare de conferenţiar şi profesor universitar, apoi să ajungă chiar conducător de doctorat în Gramatică, deşi, după cum s-a demonstrat public, nu îndeplinea condiţiile legale pentru a accede la aceste calităţi, deoarece a susţinut un doctorat nu în Filologie, ci în Istoria teatrului". Toate aceste nereguli ar fi legate de prezenţa pe lista titularilor din cadrul Universităţii "Aurel Vlaicu" a profesorului Ionel Funeriu, tatăl ministrului, fost coleg la şcoala doctorală cu rectorul Lizica Mihuţ şi bun prieten cu aceasta.
Despre profesorul Ionel Funeriu se scrie că ar câştiga "sume frumoase, care i-ar face să pălească pe dascălii care abia îşi acoperă facturile la întreţinere". Cei care îl acuză pe ministrul Funeriu analizează inclusiv perioada 1984-1987, când profesorul Ionel Funeriu a fost lector de limba şi civilizaţia română la Université des Sciences Humaines, Strasbourg (1984-1987), ridicând semne de întrebare cu privire la condiţiile în care un profesor universitar putea, în perioada comunistă, să ajungă să stea câţiva ani la Strasbourg şi "ce servicii sau instituţii ale statului ceauşist permiteau aceasta". După ce a fost profesor la Universitatea de Vest din Timişoara şi, pentru o perioadă scurtă, la Universitatea privată Tibiscus din acelaşi oraş, Ionel Funeriu a ajuns profesor la Universitatea "Aurel Vlaicu" din Arad. "În anul 2008, el a câştigat un salariu anual net de 108.000 lei, iar în 2009, conform declaraţiei publice de avere, a suferit rigorile crizei, câştigând doar 70.000 lei (net) din salarii plus 2.500 lei ca evaluator ARACIS şi din comisii de doctorat", arată presa locală, ridicând semne de întrebare cu privire la felul în care tatăl actualului ministru a
